单细胞数据库建设的研究进展

Abstract

近年来,随着以单细胞转录组测序(Single-cell RNA sequencing, scRNA-seq)技术为重点的大规模生物学实验的兴起,研究人员可以在细胞水平上展开更加深入的研究。基于scRNA-seq技术的优势,尤其是其对研究细胞异质性的能力,越来越多的单细胞数据库涌现出来,为疾病的发生和治疗提供了研究基础,特别是对于复杂的癌症和当前难以完全解决的COVID-19问题。随着scRNA-seq技术的不断发展,单细胞数据库也在不断完善和扩大,涵盖越来越多的物种数据信息,同时提供多种分析功能,为单细胞研究提供了便利。本文回顾了目前广泛使用的单细胞数据库,并对其数据量和数据类型等做了概括总结。此外,我们还调查了研究人员在数据分析方面的使用情况,并得出了单细胞数据库建设的最新进展。最后,本文还针对目前单细胞数据库存在的局限性提出了一些改进建议。

Publication
生物物理学, 2023, 11(2), 30-43